Deskripsi (Course Overview): Kursus ini adalah pengantar self-paced untuk membekali peserta dengan keterampilan fundamental dalam bioimaging dan analisis citra. Kita akan fokus pada dua aspek utama: (1) Akuisisi citra biologis menggunakan alat sederhana yang mudah diakses, seperti smartphone (baik untuk memotret objek makro seperti daun, atau dipadukan dengan mikroskop), dan (2) Analisis citra kuantitatif menggunakan perangkat lunak open-source ImageJ/Fiji. Materi dari kursus ini adalah bagian dari mata kuliah Eksperimen Dasar Biologi (BIF2211) yang diselenggarakan di Program Studi Bioinformatika, FMIPA, IPB University.

Target Peserta: Siswa SMA, Mahasiswa S1 Biologi/Bioinformatika, peneliti pemula, atau siapa pun yang tertarik mengolah data citra biologis. 

Capaian Pembelajaran Kursus (Learning Outcomes): Setelah menyelesaikan kursus ini, peserta diharapkan mampu:

1. Menjelaskan prinsip dasar bioimaging dan anatomi citra digital (pixel, resolusi, bit depth).
2. Menerapkan teknik akuisisi citra biologis sederhana menggunakan smartphone, baik untuk objek makro (daun, cawan petri) maupun mikro (via mikroskop).
3. Mengoperasikan fungsi-fungsi dasar software ImageJ/Fiji untuk pemrosesan citra.
4. Melakukan analisis kuantitatif esensial (kalibrasi spasial, pengukuran, dan penghitungan objek).
5. Membuat visualisasi data sederhana dan menyajikan hasil analisis citra secara etis.

Pengembang

Mafrikhul Muttaqin, Dr.

Departemen Biologi, Fakultas Matematika dan Ilmu Pengetahuan Alam / Program Studi Bioinformatika, Fakultas Matematika dan Ilmu Pengetahuan Alam, IPB University

Email: [email protected]

Short Bio: Mafrikhul Muttaqin has two key roles at IPB University. As a lecturer in the Biology Department and Bioinformatics Study Program, he enjoys teaching and researching how plants interact with their world. Also, he has another job as the Assistant Director for Technology and Learning Digitalization within the Directorate of Educational Transformation and Learning Technology (DTPTP). In this role, he leads projects that utilize new educational technologies and innovative approaches to enhance student learning and improve the quality of education at the university.